Estniska Församlingen i Stockholm är medlem av Estniska evangelisk-lutherska kyrkan (på estniska: Eesti Evangeelne Luterlik Kirik, förkortat EELK) och grundades under andra världskriget som den första estniska församlingen i Sverige. Efter 1944 års stora flyktingvågor blev esterna den första stora flyktinggrupp som kom att stanna i Sverige, och församlingen växte raskt till flera tusen medlemmar. Idag är antalet medlemmar lägre men högmässa med nattvard firas fortfarande regelbundet varannan söndag i Sankt Jacobs kyrka.
Församlingens kansli finns i Estniska Huset på Wallingatan 34 (2 tr.), Stockholm, och håller öppet vardagar mellan kl 10 och 14. Andra tider möten enligt överenskommelse.
